EDC.HCl是水溶性碳二亚胺,分子呈线性结构,用于羧基与伯胺的缩合反应,并已获得广泛的用途。如在多肽合成中形成酰胺健、将半抗原结合于载体蛋白形成免疫抗原、通过与核酸5"位的磷酸基团反应形成氨基反应活性的NHS-酯等。EDC 通过与氨基反应形成可与氨基反应的O-酰基脲中间体。如果该中间体不与氨基反应,则会很快水解并重新释放出羧基基团。在N-羟基硫代琥珀酰亚胺(Sulfo-NHS)存在的情况下,EDC.HCl可以将羧基转变为氨基反应活性的Sulfo-NHS酯。这步反应通过将EDC.HCl、含羧基分子以及Sulfo-NHS混合即可实现。